The Unknome：研究人員剛剛創(chuàng)建了一個我們最神秘基因的數(shù)據(jù)庫

為了增加我們對基因藍圖的理解，研究人員建立了一個我們幾乎一無所知的基因數(shù)據(jù)庫。

雖然我們知道這些基因存在并編碼蛋白質(zhì)，但我們不知道它們的用途。

“很明顯，科學(xué)研究傾向于關(guān)注經(jīng)過充分研究的蛋白質(zhì)，導(dǎo)致人們擔心知之甚少的基因被不合理地忽視，”研究者來自英國MRC分子生物學(xué)實驗室（LMB）的解釋。

“為了解決這個問題，我們開發(fā)了一個公開可用且可定制的'Unknome數(shù)據(jù)庫'。

人類基因組序列的粗略草案已經(jīng)有20年了。首次發(fā)布，包含數(shù)以萬計的基因。

從那以后，我們學(xué)到了很多東西，先進的技術(shù)像CRISPR一樣，但仍有數(shù)以萬計的這些基因仍然是神秘的。

到目前為止，這些基因被科學(xué)忽視的原因有很多，分子生物學(xué)家Jo?o Rocha及其同事解釋說。

它們包括資金和同行評審系統(tǒng)更傾向于支持對已經(jīng)證明具有臨床重要性的基因的研究，或者在實驗室物種中更豐富或更廣泛的基因。

Unknome數(shù)據(jù)庫根據(jù)對蛋白質(zhì)基因的了解程度對蛋白質(zhì)基因進行排名，這些蛋白質(zhì)基因適用于人類和實驗室環(huán)境中通常研究的其他物種。

為了證明如何使用這個數(shù)據(jù)庫，研究人員隨后采集了260個在數(shù)據(jù)庫中被列為高度未知的基因樣本，這些基因也可以在實驗室蒼蠅中找到。果蠅基因組。

他們系統(tǒng)地刪除了發(fā)育中的蒼蠅的共同基因。許多蒼蠅沒有存活下來，這表明這些基因中的每一個編碼的蛋白質(zhì)在動物生物學(xué)中起著至關(guān)重要的作用。

“這些未表征的基因不值得他們忽視，”說分子生物學(xué)家肖恩·芒羅。

通過僅在某些組織中去除基因的表達，而不是在果蠅內(nèi)的其他組織中，研究人員能夠確定它們的一些功能。一些與男性生育能力、發(fā)育和壓力反應(yīng)相關(guān)的基因。

“通過識別問題被無意和不合理地忽視的情況，有可能加速科學(xué)進步，”該團隊寫.

Rocha及其同事現(xiàn)在已經(jīng)確定了人類基因組中那些被忽視的問題，因此現(xiàn)在由世界各地的研究人員來幫助加速這一進展。

“我們的數(shù)據(jù)庫提供了一個強大，多功能和高效的平臺，可以識別和選擇功能未知的重要基因進行分析，從而加速縮小unknome所代表的生物學(xué)知識差距，”門羅總結(jié)道.

這項研究發(fā)表于公共科學(xué)圖書館生物學(xué).

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